De nombreux indicateurs peuvent être utilisés pour mesurer la biodiversité d’un site. Par exemple, la richesse spécifique mesure le nombre d’espèces différentes présentes. Un indicateur plus riche mais un peu plus complexe, la diversité phylogénétique, sera utilisé dans cet article. Il est fondé sur la notion d’arbre phylogénétique associé à un ensemble d’espèces et rend compte de l’histoire évolutive de ces espèces. D’après certains spécialistes, le taux de disparition de cette diversité est encore plus important que celui de la disparition de la richesse spécifique.
La prise en compte de l’héritage évolutif des espèces
Un arbre phylogénétique (AP) est composé d’un sommet racine, de sommets internes, de sommets feuilles qui représentent les espèces et de branches reliant ces différents sommets.
Un arbre phylogénétique,
Huit espèces d’Ours (Ursidae), e1, e2,…, e8, cinq sommets internes,
i1, i2,…, i5, et treize branches, b1, b2,…, b13, avec leur longueur en millions d’années. La DP des huit espèces vaut 84. Celle du ...
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références
Optimisation discrète. A. Billionnet, Dunod, 2007.
Conservation evaluation and phylogenetic diversity. Biological Conservation, 61, 1-10. D.P. Faith, 1992.
Building large trees by combining phylogenetic information: a complete phylogeny of the extant Carnivora (Mammalia). O.R.P. Bininda-Edmonds, J.L. Gittleman et A. Purvis, Biological Reviews, 1999.